Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Surf4Q64310 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms