Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa17Q64016 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms