Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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