Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccne1Q61457 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms