Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mre11Q61216 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms