Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf1Q61069 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Usf1Q61069 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usf1Q61069 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usf1Q61069 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usf1Q61069 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Usf1Q61069 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf1Q61069 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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