Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RelnQ60841 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RelnQ60841 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RelnQ60841 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RelnQ60841 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RelnQ60841 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RelnQ60841 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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