Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf3Q60765 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf3Q60765 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms