Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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