Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Psme4Q5SSW2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Psme4Q5SSW2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms