Protein–RNA interactions for Protein: Q5S006

Lrrk2, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrk2Q5S006 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Lrrk2Q5S006 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrk2Q5S006 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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