Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc27a5Q4LDG0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc27a5Q4LDG0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms