Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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