Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc9Q3V038 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ttc9Q3V038 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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