Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms