Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Skap2Q3UND0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms