Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp19Q3UJD6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp19Q3UJD6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms