Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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