Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q3U6N9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms