Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q3U595 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q3U595 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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