Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srsf6Q3TWW8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms