Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cwc27Q3TKY6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms