Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms