Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prr27Q3SYJ2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms