Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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