Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cers3Q1A3B0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cers3Q1A3B0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms