Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms