Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Itgb8Q0VBD0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Itgb8Q0VBD0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms