Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rab42Q0PD08 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms