Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubxn2bQ0KL01 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms