Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnnm1Q0GA42 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms