Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MitfQ08874 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MitfQ08874 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms