Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rbp2Q08652 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rbp2Q08652 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rbp2Q08652 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rbp2Q08652 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rbp2Q08652 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rbp2Q08652 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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