Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tff1Q08423 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tff1Q08423 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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