Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms