Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcr5Q04683 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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