Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1sQ02789 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms