Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HmgcrQ01237 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HmgcrQ01237 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms