Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gjb2Q00977 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms