Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smn1P97801 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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