Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfra1P97785 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gfra1P97785 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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