Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21bP86792 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21bP86792 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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