Protein–RNA interactions for Protein: P84444

Ccl21a, C-C motif chemokine 21a, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21aP84444 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl21aP84444 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccl21aP84444 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms