Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SgcdP82347 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SgcdP82347 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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