Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pkn1P70268 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pkn1P70268 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms