Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NfixP70257 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NfixP70257 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NfixP70257 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NfixP70257 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms