Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Crip1P63254 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms