Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ube2kP61087 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms