Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dpf3P58269 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dpf3P58269 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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