Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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CtnsP57757 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CtnsP57757 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms